2014年2月12日，九元航空获得民航局筹建批复，标志着均瑶集团东南两翼民航战略布局正式拉开序幕。

2014年4月2日，九元航空在广州白云区工商局登记注册，正式落户白云区人和镇。

2014年5月14日，九元航空与美国波音公司签订50架飞机采购协议，成为当时中国民营航空史上最大规模的单次采购。

2014年8月30日，九元航空第一架飞机抵达广州，编号B-1715，垂尾涂装为橙色。

2014年9月9日，九元航空第二架飞机抵达广州，编号为B-1719，垂尾涂装为深蓝色。

2014年 11月14日，九元航空获得民航局颁发的《经营许可证》，标志着九元航空正式成为中国中南地区首家低成本模式航空公司。

2014年12月2日，九元航空在广州白云国际机场隆重举行首航仪式，首班航班从广州飞往湛江。

2015年1月15日，九元航空广州=温州=哈尔滨航线开通，标志着九元航空正式投入商业运营。

2015年2月16号，九元航空第三架飞机抵达广州，编号为B-1716，垂尾涂装为玫瑰红。

2015年7月9日，九元航空第四架飞机抵达广州，编号为B-6990，垂尾涂装为嫩绿色。

2015年7月11日，九元航空第五架飞机抵达广州，编号B-6989，垂尾涂装明黄色。

2016年3月15日，九元航空第六、七架飞机抵达广州白云国际机场。其中，第六架B-6991号飞机垂尾为紫色，第七架B-6992号飞机垂尾为墨绿色。

2016年6月16日，广州首台全动态飞行模拟机在九元航空广州总部正式启用。这台售价近亿元人民币的B737-800型全动模拟机“驾驶舱”内部安装有最先进的全景模拟系统，可全真模拟包括广州、北京、上海在内的国内外30多个主要机场的场地视景，再加上真实的全球地形、地貌视景数据库，为飞行人员提供真实广阔的视觉感受和雷雨、冰雪、大雾等全天候驾驶体验。

2016年7月15日，波音公司在百年诞辰纪念日当天，向九元航空交付了首架自购新飞机，这也是波音在第二个百年中交付的首架飞机。这架同时承载了九元航空和波音梦想的737，选择了特别纪念版的金色涂装。

2016年7月19日，九元航空第八架新飞机抵达广州，编号B-1552，垂尾涂装为金色。

2016年9月3日，九元航空第九架新飞机抵达广州，编号B-1551，垂尾涂装为天蓝色。

2017年1月21日，九元航空第十架新飞机抵达广州，编号B-1553，该飞机揭晓了九元航空轮替式机身喷涂最新也是最后一款涂装色，并将涂装色命名为“新年苹果红”，寓意新年红红火火、平安圆满。

2017年1月22日，九元航空第十一架新飞机抵达广州，编号为B-1556，垂尾涂装为橙色。这是九元航空九色轮替式涂装新一轮的开始，其涂装色与九元航空2014年8月30日引进的第一架新飞机涂装色相同：橙色。

2017年2月27日，九元航空被广州市人民政府认定为“广州市总部企业”。

2017年8月29日，九元航空第十二架新飞机抵达广州，编号为B-1472，垂尾涂装为嫩绿色。

2017年9月2日，九元航空第十三架新飞机抵达广州，编号为B-1592，垂尾涂装为深蓝色。

2017年9月9日，九元航空第十四架新飞机抵达广州，编号为B-1473，垂尾涂装为明黄色。

2018年1月23日，九元航空机队空中互联网服务测试成功，成为国内首家在窄体机上实现空中互联网接入的航空公司。

2018年4月2日，九元航空第十五架新飞机抵达广州，编号为B-1233，垂尾涂装为梦幻紫。

2018年9月27日，九元航空第十六架新飞机抵达广州，编号B-1172，垂尾涂装为枚红色。

2018年10月2日，九元航空正式开通中国广州=缅甸曼德勒低成本国际航线，这标志着广州到曼德勒首条直飞低成本航线正式开通。

2018年10月30日，第十七架新飞机暨首架B737-8抵达广州，编号B-206J，垂尾涂装为大红色。

2019年1月21日，公司九色鹿义工队参加民航中南地区管理局在广州白云国际机场T1航站楼举办的“青春志愿行·奉献新时代—— 中国民航青年再出发”民航青年志愿者服务春运活动。

2019年3月1日，九元航空被国家科学技术部评定为高新技术企业。

2019年3月6日，第十八架新飞机抵达广州，编号B-208K，垂尾涂装为大红色。

2019年3月29日，在广东省交通运输协会八届四次会议代表大会暨表彰大会上，九元航空被评为“2018年度广东省交通运输行业优秀企业”，董事长纪广平被评为“2018年度广东省交通运输行业优秀企业家”。

2019年4月11日，九元航空董事长纪广平被民航中南地区管理局聘任为中南民航推进粤港澳大湾区民航建设领导小组的副组长。

2019年4月18日，九元航空被《广东科技》杂志社特聘为副理事长单位，董事长纪广平任副理事长。

2019年4月21日，九元航空加入广东省交通运输协会，任副会长单位，董事长纪广平任副会长。

2019年5月28日，九元航空完成CCAR-121部R5补充运行合格审定工作，并获局方批准成为广州首家通过R5审定的航空公司。

2019年7月8日，九元航空开启广州至柬埔寨西哈努克港直飞航线，这是中国国内航空公司首次开通这两地之间的直飞航线，为中柬

两国人民友好往来架起了价格亲民的全新空中之桥。

2019年10月18日，九元航空获得广东监管局“关于B737-800机型电子飞行包临时批准和验证测试的批复”，正式通过EFB的补充运行合格审定，进入无纸化驾驶舱运行。

2019年10月31日，九元航空第十九架新飞机抵达广州，编号B-7105，垂尾涂装为嫩绿色。

2019年11月21日，中华人民共和国广州海关正式向公司颁发AEO高级认证企业证书，九元航空正式获得海关AEO高级认证企业信用等级认证。

2019年12月2日，九元航空第二十架新飞机抵达广州，编号B-7113，垂尾涂装为苹果红。

2020年新冠肺炎疫情发生以来，九元航空一手抓“防疫生产”，仍不忘响应均瑶集团履行社会责任，以积极参与全球采购捐赠防疫物资的实际行动投入抗疫斗争，充分利用国内外航线网络资源，全力支援一线医护人员驰援抗疫，体现广东民企担当和社会责任。2020年1月27日，开通抗疫防疫援助物资空中运输绿色通道，1月29日，首家宣布在所有执飞航线免费承运抗疫一线医护工作者。1月30日，借助均瑶集团全球化产业资源，不计成本、以零售价海外抢购最为紧缺防护物资，为广东抗疫一线及时捐赠2000 套可在最高等级呼吸和皮肤危害同时存在环境中应用的A级防护服。2月6日，再次筹措1500套A级防护服，经市红十字会捐赠给广州第八人民医院，将宝贵的医疗物资及时供给到抗疫一线；向湖北地区捐赠40台制氧机等防疫物资。

九元航空以实际行动积极助力复工复产。2020年3月14日，九元航空执飞首条长沙出港复工包机，积极支持国家实施“疆电东送”能源战略重点项目，九元航空运送中国能源建设集团哈密红星项目基建团队进疆复工。3月17日，九元航空执飞中缅首条货运包机，收到缅甸中国商会求助，九元航空执飞AQ1359广州-仰光航班，紧急运送急缺物资，保障当地华商工厂正常运转，稳定海外华人就业。3月19日，不离不弃，架起湖北通道跨国回家路。3月19日-20日，分别从深圳、广州调用4架次航班，安全、有序地接回573名滞留泰国多日的湖北籍旅客。2020年6月14日开通广州-中卫客运包机航班 经过多方沟通协调，九元航空6月14日成功开通广州-中卫客运包机航班，该航班是九元航空首条支持文化产业复工复产的包机航班。

2020年3月26日，九元航空纪广平董事长参加在广州空港经济区龙港路与拟建综保区中区卡扣交界处举办的广州空港经济区项目签约动工暨龙港路通车活动，代表公司签约九元航空运营总部项目并作为企业代表发言，标志着九元航空在空港经济区进一步扎根。

2020年3月31日，九元航空顺利获得客舱载货运行资质。

2020年4月7日，九元航空携手“央视频”参与“春暖花开 国聘行动”直播活动，瞄准全球高端人才广阔引流；同时，董事长纪广平发布人才战略计划，为公司的人才战略可持续发展不断铸造坚固壁垒。

2020年4月22日，广州红十字会陈文耀部长一行2人来到九元航空，就九元航空在2020年新冠肺炎疫情爆发初期防疫物资紧缺形势下，紧急捐赠防护服3500件，表达对九元航空雪中送炭之举的诚挚敬意，并授予九元航空荣誉证书及“人道·博爱·奉献”奖牌。

2020年7月15日， 中南局李双臣副局长向九元航空纪广平董事长颁发飞行训练中心CCAR-142部合格证。九元航空是中国民航业内首家在机队规模未满10架时，即不惜重金，引进广州首台、目前也是唯一一台波音737NG全动模拟机。民航服务的根本是安全。九元航空引进这台模拟机的初衷是为旅客提供高质量的服务。

2020年9月9日，九元航空宣布会员俱乐部及常旅客积分计划正式上线发布，标志着九元航空将运用更为创新、多元、精细化的常旅客服务体系为广大旅客提供更加优惠的航旅出行产品和更为优质的服务体验。

2020年9月29日，九元航空推出各类“随心飞”伴侣型机票产品“安心飞”，九元航空创新、便捷、惠民航空服务产品的推出，积极助力提振航空旅游全产业链的消费水平。

2021年3月31日，九元航空第二十一架新飞机抵达贵阳龙洞堡国际机场，该架飞机垂尾涂装为“苹果红”。

2021年5月14日，九元航空第二十二架新飞机抵达海南琼海博鳌机场，该架飞机垂尾涂装为“绿色”。

2022年1月21日，九元航空第二十三架新飞机抵达广州白云机场，该架飞机垂尾涂装为“红色”。

2022年3月27日，九元航空正式入驻成都天府机场开通直达广州航线，首航执行顺利。

2022年5月25日起，九元航空携手广东高校共同为乡村振兴，助“荔”！九元航空以实际行动助力突破农产品销售“区域性过剩”的传统难题，为广东乡村振兴注入新动能。